Su una superficie espositiva di 1.000 m² i visitatori hanno l'opportunità di ammirare tutta la varietà del paesaggio altoatesino: dalla sua genesi geologica alla conformazione morfologica, dal reinsediamento successivo all'era glaciale fino alla sua antropizzazione.
Accanto all'esposizione permanente, il Museo organizza periodicamente mostre temporanee. Gli aggiornamenti sulle mostre sono riportati alla voce Mostre temporanee.
Un importante ambito di attività del Museo è rappresentato dalla ricerca sul territorio regionale. Al centro dell'interesse vi è innanzitutto lo studio sistematico della flora e della fauna locali nonché delle caratteristiche geologico-mineralogiche dell'Alto Adige.